Le CDEO est une coopérative agricole. Chaque année les adhérents sont réunis lors d’assemblées de section désignant des délégués pour la représentation en assemblée générale. 

 L’assemblée générale élit les membres de son Conseil d’administration. Compte tenu du rôle essentiel du CDEO dans le paysage ovin lait du département mais aussi de sa volonté d’être le plus à l’écoute possible des besoins de la filière, la représentation est élargie à des représentants de la Chambre d’Agriculture, de l’Interprofession Lait de Brebis du 64, de l’AOP Ossau Iraty, du Groupement de Défense Sanitaire ainsi que de l’enseignement agricole.

Par ce fonctionnement mais aussi les nombreux temps d’échanges organisés avec les adhérents (commissions raciales, réunions techniques, …) le CDEO reste une structure proche de ses producteurs et de son territoire revendiquant un fonctionnement démocratique et participatif.